毛竹GRAS基因家族的全基因组分析与表达检测
GRAS转录因子是植物特有的一类转录因子,在植物发育和信号转导方面具有重要作用.通过生物信息学方法,从毛竹基因组中共找到GRAS基因序列76个,根据基因及其编码蛋白的结构特征,并通过与模式植物拟南芥和水稻GRAS同源序列的比较分析,结果表明,有60 个分别属于HAM、AtSCR、DLT、AtSCL3、DELLA、AtPAT1、AtSHR 和LISCL 等8 个亚家族,另外16 个属于未知家族.分别从8 个不同的亚家族选取一个代表基因,用于组织特异性表达检测.结果表明,8 个不同亚家族的代表基因的表达模式各不相同,其中5个基因表达丰度的最高值都出现在根中,2 个基因在叶片中,1 个基因在幼茎中,这说明它们的表达具有组织差异性,意味着GRAS家族转录因子功能的多样性.
毛竹 GRAS转录因子 全基因组分析 表达调控 生物信息学
董丽莉 孙化雨 赵韩生 王丽丽 娄永峰 高志民
国际竹藤中心,竹藤科学与技术重点开放实验室,北京,100102
国内会议
浙江丽水
中文
85-93
2014-10-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）