测序分型中2例样本HLA-DQB1等位基因第2外显子PCR扩增丢失及其原因分析
目的：探讨HLA-DQB1基因测序分型时等位基因漏检和丢失的原因,以进一步提高HLA测序分型的准确性. 方法：2000例随机选择的捐献者及患者血样,采用AlleleSEQR HLA-DQB1测序分型试剂盒进行检测,对序列峰图”异常”及无完全匹配结果的样本,进一步采用PCR-rSSO流式磁珠法复检,同时采用自行设计的组特异性PCR引物进行PCR产物分子克隆和测序方法进行单倍体序列分析. 结果：2000例经AlleleSEQR HLA-DQB1测序分型的样本中,发现2例样本序列峰图”异常”,经PCR-rSSO流式磁珠法复检为杂合型样本,经自行设计的组特异性PCR引物进行PCR产物分子克隆和测序方法进行单倍体序列分析证实,第1例样本为第2外显子PCR扩增丢失HLA-DQB1*02:02等位基因序列,第2例样本为第2外显子PCR扩增丢失HLA-DQB1*02:01:01等位基因序列,未发现新的碱基点突变. 结论：HLA-DQB1基因测序分型时,因DQB1基因存在优势扩增现象可导致等位基因的漏检和丢失.根据中国人群HLA-DQB1分子序列特点,开发适合于中国人群的测序分型试剂十分必要.
人类白细胞抗原 等位基因 第2外显子 测序分型方法 聚合酶链技术 扩增丢失现象
高素青 王大明 徐筠娉 邓志辉
深圳市血液中心,深圳市组织配型与免疫遗传重点实验室 518035
国内会议
杭州
中文
224-229
2013-05-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）