基于蛋白质相互作用网络的甲型流感病毒宿主因子预测
本文对甲型流感病毒(IAV)-人类相互作用从蛋白质层面进行了网络分析.研究发现,IAV强烈倾向于与具有特定拓扑特征和生物功能的人类蛋白质结合.基于这些拓扑特征和生物特征,应用支持向量机结合遗传算法建立了识别模型.基于留一法交叉验证,总预测精度为71.4％.将该模型用于9706个人体蛋白质,最终从人体相互作用组中识别了1418个新的靶标基因,其中部分基因已经被证实在IAV感染中起了重要作用.
甲型流感病毒 宿主因子预测 蛋白质相互作用网络 潜在靶标 拓扑特征 生物功能
赖燕华 李占潮 陈丽丽 戴宗 邹小勇
中山大学化学与化学工程学院,广州,510275;广东中烟工业有限责任公司,广州,510610 广东药学院化学与化学工程学院,广州,510006 中山大学化学与化学工程学院,广州,510275
国内会议
苏州
中文
61-62
2013-10-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）