基于人工免疫系统的蛋白质相互作用网络聚类算法
提出了一种基于人工免疫特性的蛋白质相互作用(PPI)网络聚类模型与算法以期提高其辨识准确率.在该算法中将聚类中心作为抗原,将邻接的节点作为抗体,通过计算抗体与抗原之间的亲和度,将其作为记忆细胞把节点划分到聚类中;然后选择优秀抗体作为疫苗,尝试将疫苗注入聚类模块并进行更新,通过与注射前的模块适应度进行比较,不断更新记忆细胞.对PPI数据集上的数据进行了仿真,实验结果表明,与功能流算法(FLOW)相比,所提方法的正确率和查全率的几何平均值均得到了提高.
人工免疫系统 蛋白质相互作用 聚类算法 性能测试
王冲 雷秀娟
陕西师范大学 计算机科学学院,西安 710062
国内会议
昆明
中文
3567-3570
2013-08-16(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)