藏鸡EPAS1基因的多态性及表达差异分析
本文采集日喀则藏鸡、寿光鸡和白来航3个群体血液样品，用苯酚一氯仿法提取基因组DNA。设计引物19对扩增EPASl基因17个外显子、5”端5000 by和3”端2000by序列，每个群体10个个体PCR产物等量混池测序，比对分析SNP，选择相应的内切酶检测群体多态性。采集藏鸡、茶花鸡、寿光鸡3个品种种蛋进行低氧和常氧孵化，于孵化第9,11和16天采集尿囊绒毛膜组织，提取总RNA，以GAPDH为参照基因，进行RT-PCR，计算相对表达量，以多重比较法分析品种间的差异。在鸡EPASI基因5”侧翼5000bp范围内发现28个突变位点，其中置换突变26个，插人或缺失位点2个;在3”侧翼2000bp范围内发现9个突变位点，其中置换突变8个，插人突变1个;在EPASl基因的17个外显子区域发现7个突变位点，其中错义突变位点4个，同义突变位点3个;另外，在部分内含子区域发现45个突变位点，其中置换突变42个，插人或缺失位点3个。低氧孵化增加藏鸡、茶花鸡、寿光鸡EPAS1基因表达，尤其在第9和11天低氧反应更敏感。藏鸡EPAS1基因表达在lld时低氧反应敏感，表达模式与茶花鸡相近，寿光鸡EPAl表达低氧反应均不敏感。EPAS1基因编码低氧诱导因子2(HIF-2)，是低氧适应的重要候选基因，在整个低氧适应过程中起着中枢纽带作用，与靶基因结合，促进一系列基因表达，改善氧供应，以恢复氧平衡，使细胞、组织和机体在低氧条件下存活和生长。
藏鸡养殖 缺氧诱导因子2α 基因多态性 表达差异性
苟文钰 凌遥 张倩 张浩
中国农业大学畜禽育种国家工程实验室,北京 100194
国内会议
江苏扬州
中文
171-171
2013-05-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）