蛋鸡沙门菌感染的差异表达基因的筛选
选用100只20周龄的健康状况良好，体重相近的白来航鸡为试验材料，随机分成2组，60只接种肠炎沙门菌，作为试验组，另外40只接种等剂量的PBS，作为对照组。两组鸡分开饲养，饲养条件相同。分别在接种后8天和16天随机选择对照组11只，试验组29只采集脾脏组织样品，保存于RNA保存液中，于一20℃保存用于RNA的提取。采用Trizol法抽提RNA并纯化，每个时间点每组内随机选取8个样品，组内两两混合，形成16个RNA混池，用安捷伦4x 44K鸡全基因组表达芯片进行杂交。采用SAS软件进行数据处理与分析，并用DAVID在线分析工具对差异基因进行GO注释分析。接种后8天的实验组和对照组进行比较，沙门氏感染后共有1371个基因的表达差异显著，其中包括689个下调基因和682个上调基因，在下调基因中差异倍数最大的基因为LOC416235(5.453)，在上调基因中，差异倍数最大的基因为LOC417973(7.047);接种后16天的实验组和对照组进行比较，沙门氏感染后共有692个基因的表达差异显著，其中包括319个下调基因和373个上调基因，在下调基因中差异倍数最大的基因为HBE1(4.132)，在上调基因中差异倍数最大的基因为INPPSF(5.237)。分别对上调和下调差异基因进行GO分析，差异基因分布在多个不同的生物学过程，同时相同的基因有可能出现在不同的生物学过程中。沙门菌感染致使某些和免疫相关的基因差异表达。
蛋鸡养殖 遗传育种 沙门菌感染 差异表达基因
齐玉凯 孙钰 李显耀
山东农业大学动物科技学院,山东泰安271018
国内会议
江苏扬州
中文
176-176
2013-05-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）