鸡miR-148a的组织表达及其发育调控功能预测分析
目的：旨在明确miR-148a的时序和组织表达特征，挖掘其在鸡发育过程中的潜在调控功能。方法：采集固始鸡5个发育阶段的下丘脑、大脑、小脑、延脑、心、肝、肺、肾、胰、脾、肌胃、腺胃小肠、胸肌和腿肌共15种组织用于表达谱构建。利用primerScriptTM RT reagent Kit对总RNA进行反转录；采用Hairpin-itTM miRNAs qPCRQuantitation Kit检测各组织中miR-148a的表达。利用Pictar和TargetScan算法预测miR-148a的靶基因。利用DAVID Bioinformatics Resources 6.7中的资源对预测靶基因进行Gene Ontology(GO)分析和通路分析。结果：miR-148a在胚胎期各组织中的表达水平明显低于出壳后;miR-148a在出壳后的大脑、小脑、延脑、腺胃、小肠、肝、胰和胸肌等器官组织中的表达水平随着发育进程被显著上调。miR-148a预测靶基因在胚胎器官形态发生、消化道形态发生、心血管发育、感觉器官发育、肠发育、骨骼系统发育、后脑发育、呼吸系统发育、免疫系统发育等发育过程显著富集。结论：miRNA表达谱研究是进行miRNA功能研究的第一步，可为深入了解特定miRNA生物学功能提供有益线索。本研究证明，鸡miR-148a为一广泛性表达miRNA，在所检测的5个发育阶段、15种组织中均有表达，且呈现明显的时序特征。己知miRNA通过抑制其靶mRNA的翻译而发挥生物学调控功能。本研究中，miR-148a预测靶基因的富集分析结果与其组织表达谱分析结果存在较高的一致性，这暗示miR-148a可能参与鸡多种器官组织的发育调控。
鸡 miR-148a基因 组织表达 生长发育 调控功能
李国喜 闫峰宾 贾丽娟 康相涛
河南农业大学牧医工程学院,河南省家禽种质资源创新工程研究中心,郑州450002
国内会议
郑州
中文
601-601
2013-11-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）