生物基因测序高性能计算日志的任务分析及建模
生物基因测序是生物信息学分析中最常用的高性能计算任务本文旨在通过分析生物基因测序日志找出生物基因测序日志中的任务特性,构建一种通用的适合分析生物基因测序的任务模型,并应用于面向基因测序的高性能计算系统的任务调度及性能优化基于任务日志,本文主要分析了生物基因测序日志中任务到达时间的规律特性,任务运行时间和任务的并行尺寸等特性,通过这些任务特性利用指数分布,伽马分布,正态分布以及线性拟合构建了相应的局部任务模型,然后提出一种局部模型融合的方法一寻各个局部模型合并为统一的任务模型通过两种通用的模型评测方法对任务模型进行的评测结果显示最终的任务模型同原有任务日志在四种任务属性的趋于相同的分布,验证了本文构建的任务模型具有很好的通用性.
生物基因测序 计算日志 任务模型 性能优化
曹志波 董守斌 王丙强
华南理工大学计算机科学与工程学院通信与网络重点实验室,广东广州510641 深圳华大基因研究院,广东深圳 518083
国内会议
桂林
中文
145-154
2013-10-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）