甘蓝抗枯萎病基因的精细定位
甘蓝枯萎病由尖孢镰刀菌粘团转化型引起,严重影响着甘蓝的产量和品质.本研究利用甘蓝高抗亲本和高感亲本杂交获得F1,然后通过F1自交获得包含4000个单株的F2群体,利用F1的花蕾进行游离小孢子培养获得包含160个系的DH群体.利用双亲全基因组重测序数据设计的InDel引物,通过DH群体将基因初步定位于384 kb区间内;然后利用F2群体进一步将基因定位于84 Kb范围内.通过甘蓝基因组注释,发现该范围内共有10个基因.其中3个基因可能与抗病性有关,扩增基因全长后将其中2个排除,另外一个只含有TIR结构域的基因根据FGENSH重新预测为一个完整的TIR-NBS-LRR类型R基因,命名为FOC1.对比抗、感病亲本FOC1基因的eDNA序列发现,感病亲本由于插入一个碱基A导致移码和终止突变而不能翻译出正确的蛋白质.扩增10份抗病材料和10份感病材料的cDNA发现,10份抗病材料cDNA相似度很高且无InDel,而感病材料的cDNA均存在插入或者删除造成移码突变.由此我们推断,重新预测的基因FOC1很可能为甘蓝枯萎病抗性的候选基因.
甘蓝 枯萎病 FOC1基因 尖孢镰刀菌 精细定位
吕红豪 谢丙炎 杨宇红 王晓武 康俊根 方智远 杨丽梅 张扬勇 刘玉梅 庄木 刘博
中国农业科学院蔬菜花卉研究所,农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室,北京 100081 北京市农林科学院蔬菜研究中心,国家蔬菜工程技术研究中心,北京 100097
国内会议
丽江
中文
159-165
2013-10-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）