番鸭小鹅瘟弱毒D株NS蛋白抗原位点特征分析
为了获得番鸭(Cairina moschata)小鹅瘟病毒(Goose parvovirus,GPV)弱毒株(MDGPV-D)非结构蛋白NS基因的相关信息,根据已发表的MDGPV-PT株全基因序列,应用DNAStar分子生物学软件设计一对引物,采用高保真PCR技术扩增MDGPV-D株NS全基因序列.本研究对番鸭小鹅瘟病毒疫苗弱毒D株(MDGPV-D)NS基因进行克隆、测序并利用生物信息学技术分析MDGPV-D株NS蛋白的同源性、遗传衍化、N-糖基化位点、磷酸化位点、B细胞抗原表位、T细胞抗原表位及其二级结构.结果表明,D株NS全基因大小为1884 bp,编码627个氨基酸(GenBank登录号:JF926696),与MDPV NS基因的亲缘性最近核苷酸及其推导氨基酸同源性分别为97.9-98.6％, 97.6-98.2％; MDGPV-D株NS蛋白具有3个潜在的N-糖基化位点和27个磷酸化位点,可能存在1 1个B细胞抗原表位,13个CD8+CTL表位,10个CD4+Th抗原表位;二级结构分析显示,α螺旋和无规则卷曲含量高,分别为40.67％,41.15％,而β转角仅占4.63％.与亲本强毒PT株相比,弱毒D株的NS蛋白存在2个定点突变,分别位于核苷三磷酸区域(第338位氨基酸)与CD4+Th抗原表位(第225位氨基酸).本研究结果为进一步阐释MDGPV致弱的分子机理提供依据.
番鸭小鹅瘟病 抗原表位 基因序列 生物信息技术
王劭 程晓霞 陈少莺 朱小丽 陈仕龙 林锋强 李兆龙
福建省农业科学院畜牧兽医研究所 福州 福建 350013;福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心 福州 福建 350013
国内会议
武夷山
中文
54-62
2013-09-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）