结合支持向量机和分子对接的方法虚拟筛选IMP-1型金属-β-内酰胺酶抑制剂
目的:金属-β-内酰胺酶能够广泛水解β-内酰胺类抗生素,目前临床上尚无针对其有效的抑制剂。因此,近年来金属-β-内酰胺酶抑制剂的开发受到重视。方法:本论文结合支持向量机(SVM)和对接的方法虚拟筛选IMP-1 型金属-β-内酰胺酶抑制剂。在SVM 建模中,采用逐步筛选描述符(SDS)的方法实现描述符的自动筛选。这种结合SVM 和对接的筛选方法极大的提高了命中率和筛选速度,节省了计算资源。结果:用建好的模型虚拟筛选组合化合物数据库,命中25 个化合物,购买8 个用来做体外活性测试。其中有4 个化合物对IMP-1的抑制活性值IC50 在微摩尔级水平。这4 个活性化合物中,有两个化合物具有全新的骨架结构,可进一步改造优化。结论:结合SVM 和对接方法进行虚拟筛选可用于高效开发金属-β-内酰胺酶抑制剂。
IMP-1 型金属β-内酰胺酶抑制剂 支持向量机 对接 虚拟筛选
陈姣 郑珩 姚文兵
南京市南京市童家巷24号中国药科大学172#,210009
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2012-11-01(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)