三种DNA提取法在杨树人工林根际土壤微生物分析中的比较
本文以杨树不同品种及其伴生树种(苏柳797；江南桤木)的根际土壤为研究对象,分别采用SDS-高盐缓冲液抽提法、CTAB缓冲液提取法及试剂盒法进行DNA的提取,并通过DNA得率、纯度及16S rDNA V3可变区的PCR 扩增结果对3种提取方法进行比较。结果表明：SDS-高盐缓冲液提取方法的DNA 得率和纯度均较低,电泳检测结果不明显,并且后续PCR 扩增过程条带不清晰,拖尾严重,不太适合用于杨树人工林根际土壤微生物多样性分析；试剂盒法提取操作比较简单,实验周期短,但针对本研究的根际和非根际土壤DNA的提取效果较差,而且价格昂贵,在本研究中尽量不要使用；相对而言,CTAB 抽提法既保证了一定的提取与回收效率,同时兼顾了DNA的提取质量,在提取和纯化过程中微生物DNA 受到机械损伤较少,片段完整,并且成本最低,初步认为该方法较为适合本研究中不同类型土壤总DNA的提取。
杨树人工林 根际 土壤微生物 DNA提取 PCR
刘东 田野 方升佐
南京林业大学森林资源与环境学院,江苏 南京 210037
国内会议
成都
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1-11
2010-07-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）