基于SNP芯片进行苏尼特羊选择信号检测
目的:通过苏尼特羊全基因组选择信号检测,寻找与选择相关的基因,揭示重要经济性状的遗传机制以及正向选择(Positive selection)在苏尼特羊品种培育过程中的作用机理.方法:文章基于illumina Ovine 50K芯片,采用r2度量苏尼特羊全基因组连锁不平衡程度(Linkage disequilibrium,LD),并利用单倍型积分值(Integrated haplotype score,iHS)选择信号检测方法对苏尼特羊进行全基因组选择信号检测.结果:共筛选到244个选择信号区段,并对这些区段进行基因注释找到979个候选基因,其中包括KDR、RUNX2、SOX6等与繁殖性状和骨骼发育相关的基因.最后通过生物信息学分析发现这些基因聚类在生物学过程、分子功能和细胞组分三个方面.结论:构建了苏尼特羊的LD图谱和正向选择信号图谱.
苏尼特羊 基因芯片 信号检测 遗传育种
王光凯 曾滔 王慧华 张淑珍 张莉 魏彩虹 赵福平 杜立新
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193;四川农业大学动物科技学院,雅安625014
国内会议
山西太谷
中文
135-146
2013-08-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）