一种有效的肿瘤特征基因筛选方法

摘要：

本文提出一种新的特征基因选择方法(PLS_ VIP_ CFFS),将偏最小二乘变量投影重要性指标与启发式前向搜索结合.利用PLS_ VIP_ CFFS对胃癌、肺癌、白血病等4组基因表达谱数据进行特征基因的选择,将选择结果与支持向量机等分类方法结合未处理原数据集,考察特异性、敏感性及平均准确率等指标,并从生物学角度分析选取的特征基因.PLS_ VIP_ CFFS在4组数据集上选取的特征基因具有较强的生物意义,结合多种分类器所得各项指标以及分类正确率都比较高,因此,PLS_VIP_CFFS可作为一种可靠的特征基因选取方法.

关键词： 数据处理 偏最小二乘法 支持向量机 基因筛选

作者: 李建更 李辉 阮晓钢

作者单位: 北京工业大学电子信息与控制工程学院,北京,100124

会议类型: 国内会议

会议名称: 2013年中国智能自动化会议

会议地点: 扬州

会议语种:中文

页码: 284-288

在线出版日期: 2013-08-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）