基于RNA测序技术的葱蝇转录组分析
本文以葱蝇(Delia antiqua)为研究对象,运用新兴的RNA高通量测序技术对其开展转录组测序、组装和生物信息学分析.对葱蝇转录组测序,得到53,814,782条原始Reads,总核苷酸数为4,634,750,520nt.其中,未知碱基、GC含量、Q20的百分比分别为0.00％、98.24％和39.03％.对原始Reads进行拼接组装,得到29,659条Unigene,与Nr数据库、Nt数据库、Swissprot数据库、KEGG数据库、GO分类和COG数据库比对,分别有21,041、10,023、15,873、14,182、6,600个转录本被注释或分类.本研究的结果丰富了葱蝇cDNA数据资源,为探讨葱蝇相关基因的分子特性,进化规律及功能奠定了坚实的基础;对认知葱蝇滞育及其调控的分子机理具有重要的科学意义.
葱蝇 转录组基因 RNA测序技术 分子特性 进化规律
车燕飞 张玉娟 陈斌
重庆师范大学生命科学学院,昆虫与分子生物学研究所,重庆401331
国内会议
重庆
中文
83-89
2012-10-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）