弗氏柠檬酸杆菌感染诱导斑马鱼皮肤差异表达基因研究
从草鱼肠道中分离到1株细菌,通过形态学观察、生理生化特征和16S rDNA序列分析等鉴定为弗氏柠檬酸杆菌(Citrobacter freundii),动物试验结果表明对斑马鱼有致病性；从感染诱导的斑马鱼皮肤组织中提取总RNA,经Biotin荧光标记与拥有15617个cDNA片段的斑马鱼基因芯片(Affymetrix)杂交筛选分析,结果获得斑马鱼皮肤免疫相关差异表达基因88个,其中有74个上调表达基因(ratio＞2.0)和14个下调表达基因(ratio＜0.5)；进一步根据基因文库同源功能基因(GO)分析,初步将88个差异表达基因分为8个生物学功能,其中主要参与补体激活、急性期反应、应激防御反应、细胞调亡、抗原加工提呈、细胞迁移粘附、凝血因子和血小板激活等免疫应答过程；同时进行通路(pathway)分析,结果表明MAPK (hsp70、daxx、nfkbiab)、JAK/STAT (ifn1)和TGF-β(thbs1)等信号通路参与斑马鱼皮肤抗弗氏柠檬酸杆菌感染免疫应答.采用基因芯片方法筛选与鱼类皮肤免疫相关的功能基因,为将来以斑马鱼为模型研究鱼类皮肤局部免疫应答的分子机制提供科学依据.
弗氏柠檬酸杆菌 斑马鱼 皮肤 基因表达 基因芯片
吕爱军 胡秀彩 朱静榕 薛军 王艺
徐州师范大学生命科学学院,江苏徐州221116 江苏省药用植物生物技术重点实验室,江苏徐州221116
国内会议
厦门
中文
215-215
2011-11-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）