合浦珠母贝基因组微卫星富集文库的构建与分析
采用生物素标记的(AC)15探针和磁珠富集法构建了合浦珠母贝(Pinctada fucata)基因组微卫星富集文库.随机挑选2097个进行PCR筛选,得到483个候选克隆(23.03％),对其中135个阳性克隆测序分析发现122个克隆含有微卫星重复单元(90.37％).进一步通过序列比对,最终得65个具有特异微卫星序列的阳性克隆(53.28％),包含85个微卫星DNA结构域,其中perfect(完美型)70个,占82.36％；imperfect(非完美型)7个,占8.24％；compound(混合型)8个,占9.41％,重复次数主要分布于5-20之间(95.74％),平均重复次数为7.83,(AC/GT)n重复所占比例最高(75.53％),这表明(AC/TG)n在合浦珠母贝基因组DNA中含量非常丰富.基于微卫星两端的侧翼序列,利用PP5.0设计并获得了14对能够在合浦珠母贝基因组中有效扩增的微卫星多态性引物.本研究旨为进一步开展合浦珠母贝分子育种及资源评价分析提供基础资料.
合浦珠母贝 微卫星 磁珠富集
油九菊 黄桂菊 范嗣刚 郝博飞 陈飞飞 喻达辉
中国水产科学研究院南海水产研究所,广东广州510300;上海海洋大学水产与生命学院,上海201306 中国水产科学研究院南海水产研究所,广东广州510300
国内会议
厦门
中文
332-332
2011-11-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）