棉花功能标记开发的策略及应用
棉花是世界上重要的纤维作物和油料作物.相对于棉花的重要地位,棉花的基础研究相对落后,主要原因是棉花相应的分子生物学资源比较缺乏.分子标记是遗传研究的基础工具,广泛应用于遗传多样性研究、种质鉴定、遗传图谱构建和基因定位等领域.然而,早期棉花的分子标记非常缺乏;至2003年,不足700对SSR引物.为了丰富棉花的分子标记资源,2003年,作者将SRAP标记应用于棉花研究.之后,大量涌现的EST-SSR标记大大促进了棉花相关研究.目前,CMD网站上的棉花SSR标记已达17448对. 分子标记分为Anonymous marker(匿名标记)和Functional marker(功能标记).由于功能标记来自于基因组的表达序列,因而,更有可能与性状关联,成为分子标记开发的新趋势.棉花开发最多的功能标记是EST-SSR.本实验室从海岛棉、草棉、亚洲棉、雷蒙德氏棉和陆地棉中开发了近4000对HAU系列的EST-SSR引物,这些标记在国际上被广泛使用,具有广泛的国际影响力.除了ESTSSR功能标记外,还采用多个策略开发多种类型的功能标记.利用棉花基因序列的3′UTR和内含子信息开发了SNP和Indel标记;开发了在纤维发育过程中特异或优势表达基因的特异功能标记;利用陆地棉EST数据库和海岛棉EST数据库开发种内和种间的EST-SNP标记.这些分子标记已应用于棉花高密度分子标记遗传图谱构建和基因定位等研究中. 在分子标记的分型技术方面,除了传统的变性聚丙烯酰胺凝胶电泳外,本实验室还将SSCP技术引入到SSR标记和其他功能标记的分析中.该技术可以使很多原来没有多态性的SSR标记产生多态性;在功能标记的分析时,也可以更大限度地获得多态性位点.
棉花 功能标记 品种开发 基因序列
林忠旭
华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室,湖北 武汉 430070
国内会议
长沙
中文
85-85
2013-08-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）