深测序和基因芯片技术用于mRNA表达谱检测的比较研究

摘要：

　　本研究通过检测两种细胞系mRNA表达谱和其中差异表达基因的分析，比较了基因芯片和基于深测序技术的数字基因表达标签谱(DGE)这两种技术对基因表达谱的检测能力、技术重复性、动态范围和检测结果间的一致程度。结果显示，基因芯片在对整个转录组的检测能力和在平台内部的重复性方面，均不明显弱于DGE平台。但基因芯片数据跨平台稳定性差，难以满足多中心研究的需要，且其各方面技术指标无法像DGE随测序深度增加而获得改善。

关键词： 基因表达谱 基因芯片 测序 DGE

作者: 冯林 刘宇 刘航 陆志科 高燕宁 张开泰 程书钧 张勇

作者单位: 中国医学科学院北京协和医学院 肿瘤医院肿瘤研究所分子肿瘤学国家重点实验室病因及癌变研究室 北京 100021 深圳华大基因研究院 深圳 518083

会议类型: 国内会议

会议名称: 第十一届中国科协年会

会议地点: 重庆

会议语种:中文

页码: 56-59

在线出版日期: 2009-09-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）