四个黄牛品种Y-SNP单倍型多样性
从湖北麻城、竹山县、恩施州和陕西渭南分别采集大别山黄牛、郧巴黄牛、恩施黄牛和秦川牛公牛样品96份,其中大别山黄牛36份,郧巴黄牛27份,恩施黄牛9份和秦川牛24份.颈静脉采血,肝素抗凝,低温带回实验室.酚/氯仿法抽提基因组DNA.利用PCR-SSCP法对4个品种黄牛Y染色体特异SNP位点ZFY-9,ZFY-10,DDX3Y-7,DDX3Y-1和UTY-19进行多态性分析.PCR-SSCP分型后,挑选每个位点每种带型的3个个体PCR产物进行双向测序.利用Lasergene软件的MegAlign和SeqMan程序对DNA序列进行比对,根据Y-SNPs定义个体的单倍型；利用Arlequin v3.5软件计算单倍型频率和多样性(H±SD).结果发现5个Y-SNP位点中ZFY-9,ZFY-10,DDX3Y-7,DDX3 Y-1表现多态,均表现为2种带型,而UTY-19表现单态.4个多态Y-SNP定义了两种之前报道的单倍型,其中74个个体为普通牛Y2单倍型,22个个体为瘤牛Y3单倍型,未发现普通牛Y1单倍型.4个黄牛品种中单倍型频率各异.普通牛Y2单倍型在秦川牛、大别山黄牛和郧巴黄牛中占据优势,而瘤牛Y3单倍型则在恩施黄牛中呈现优势.在4个黄牛品种中,郧巴黄牛的单倍型多样性最丰富(0.4330±0.0750),大别山黄牛则分化程度最低(0.1079±0.0680).与许多国外牛品种相比,本研究的4个黄牛品种表现较低的多样性(0.2633±0.1030).
中国黄牛 Y-SNP 单倍型 多样性
程明 郑静 汪晓菲 魏成文 张润锋
湖北师范学院生命科学学院,黄石435002
国内会议
武汉
中文
52-52
2012-10-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）