基于MPI和CUDA的蛋白质定量软件的设计和分析

摘要：

　　本文介绍了蛋白质定量软件的设计及测试结果.分析结果表明：P-QuantWiz软件在曙光6000的Intel集群部分,测试规模达到2048核,在256核加速比仍在增加.相对P-QuantWiz软件在单CPU运行的结果,PG-QuantWiz软件在单GPU运行的加速比为8.1.PG-QuantWiz软件在16个GPU运行结果相对在单个GPU运行结果,加速比为14.18,效率为89％.

关键词： 蛋白质定量 软件设计 并行算法

作者: Zhank Ke 詹科 Wang Jing 王靖 Yuan Liang 袁良 Zhang Yunquan 张云泉

作者单位: Laboratory of Parallel software and computational science,ISCAS,Beijing 100190 中国科学院软件研究所并行软件与计算科学实验室,北京 100190

会议类型: 国内会议

会议名称: 2012全国高性能计算学术年会

会议地点: 张家界

会议语种:中文

页码: 1-8

在线出版日期: 2012-10-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）