基于氢键的蛋白质与配体的对接算法研究
本文提出了一种新的计算对接的方法。把蛋白和配体上可能形成氢键的原子抽象为空间中的点，把对接过程抽象为代表氢键供体原子的点和代表氢键受体原子的点相互靠近。可以求得蛋白与配体的一个相对位置，当蛋白与配体位于该位置时，可以使尽可能多的氢键形成，则该位置就是最优的对接状态。并根据以上模型设计相应的算法，对文献上报道的6个实例进行了计算，将计算得到的对接状态和天然的对接状态对比，以均方根误差(RMSD)值表征配体的预测位置和天然位置之间的差别。
化工计算 计算机应用 蛋白质 配体 对接算法
罗文嘉 母斌 朱玉山
清华大学化工系,北京100084
国内会议
西安
中文
1080-1080
2008-10-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）