猪繁殖与呼吸综合征病毒SCwhn09CD株全基因组测定分析
猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)SCwhn09CD株为本实验室某规模化猪场分离,通过分段设计引物,RT-PCR方法对猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)SCwhn09CD株全基因组扩增,对各片段克隆、序列测定和拼接获得全基因组序列。分析发现，SCwhn09CD株全长15329bp(包括PolyA尾)，其中包含189-nt5”UTR，151nt3”UTR.，SCwhn09CD毒株与JXA1，CH-1a，MN184C，VR2332全基因组序列相似性分别为98.7％，94.4％，84.6％，89.0％，与欧洲型代表毒株LV序列相似性为60.9％，遗传进化分析表明，SCwhn09CD毒株与JXA1毒株最近。此外，发现Nsp2基因在JXA1毒株30个氨基酸的缺失上，在14-20出现新的7个氨基酸的缺失。LOWESS分析发现，猪繁殖与呼吸综合征病毒全基因组中出现4个变异区域，分别在1450～3500nt，4750～5250nt，6250～7500nt，13500～14500，其中1450～3500为变异较大的区域。本研究丰富了毒株信息，为猪蓝耳病的防治、新型疫苗备选毒株的筛选具有重要意义。
猪繁殖与呼吸综合症 SCwhn09CD株 病毒基因 全基因组扩增
周英顺 王红宁 杨鑫 张安云 曾博 徐昌文 管中斌 张志坤 姬高升 康润敏 李鑫
四川大学生命科学学院,动物疫病防控与食品安全四川省重点实验室生物资源与生态环境教育部重点实验室,“985工程”西南资源环境与灾害防治科技创新平台四川,成都610064
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251-258
2012-11-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）