基于HCV6Kb扩增子的动态准种优势株的确定及包膜2基因正选择位点分析
目的：探讨E2基因的正选择位点分布及其与已知功能区之间的关系。方法：从中国人HCV感染患者系列标本库(CQueen cohort)中筛选出3例未经IFN抗病毒治疗的1h型HCV慢性感染者及其3个不同时间点共9份血清样本作为研究对象，用内嵌的固定效应似然法检测各患者基于6Kh长序列的E2基因的正选择位点，将所检测到的位点与E2基因已知功能区进行比对，分析各位点的功能意义。结果：通过对每例HCV慢性感染者6Kb长序列的E2基因动态变化的准种变异株的适应性进化分析，发现慢性HCV感染者体内的E2区准种复杂程度并非随着感染时间的延长而进行性增高，在某个时间点上准种变异株的序列可能会趋于一致。结论：慢性HCV感染过程中，E2基因位于重要功能区的as位点受到了宿主强烈的免疫压力，as、aa399及aa 410位点的变异可能导致HCV发生体液免疫逃逸；而aa475和aa522位点的变异则可能通过影响HVR2区的功能，或改变HCV E2-CD81分子的亲和力，或改变CD81分子的结构而导致HCV发生固有免疫逃逸。
丙型肝炎病毒 准种优势株 基因序列 免疫逃逸
朱研 毛青 兰林 胡亚君 谭朝霞 张长江 王宇明 王小红
第三军医大学西南医院全军感染病研究所
国内会议
重庆
中文
270-274
2012-04-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）