解脂耶氏酵母代谢网络模型的构建与分析
随着全球经济的迅速发展,能源日渐短缺的问题越来越突出,开发和利用可再生能源的需求也愈显迫切。微生物生产所获得的生物柴油是一类清洁的有潜力的新型替代能源。解脂耶氏酵母是模式产油脂酵母,具有较好的脂肪酸合成性能,然而针对该菌株的代谢网络解析以及途径工程改造的研究手段仍然有限。基于解脂耶氏酵母的全基因组序列，以KEGG、IMG、UniprotKB及Enzyme等数据库为基础筛选注释信息，加以合理的修正及整理，构建出该菌的基因组规模代谢网络。并通过VBA编程将网络模型转化成Matlab可读的数学模型，通过填补代谢网络缺口等最终构建出该产油脂模式菌株基因组规模代谢网络模型iYL619_PCP。该模型包含619个基因，847个代谢物，1148个反应，模型中添加了127个交换反应，240个运输反应及13个自发反应。利用该模型，通过计算机模拟预测了该菌株在29种不同培养基下的生长，准确率达83％。确定了该菌株的最小培养基，通过流平衡分析预测出该菌的143个必需基因，同时通过流扰动分析为构建该菌突变株作指导。该菌基因组规模代谢网络模型的构建及模拟仿真对于实际的菌株代谢工程改造具有一定的指导意义。
生物柴油 解脂耶氏酵母 代谢网络模型 模拟仿真
潘鹏程 花强
生物反应器国家重点实验室,华东理工大学 上海,上海,200237
国内会议
上海
中文
49-49
2012-08-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）