会议专题

基于系统生物学研究维生素C工业生产菌株

  本实验室以前期对维生素C工业生产菌株K vulgare WSH001 和B.megaterium WSH002全基因组序列进行了测序和基因组分析。以此为基础,结合文献信息和公共数据库,分别构建了两菌的基因组规模代谢网络模型iWZ633和iMZ992。通过必需反应分析发现在合成培养基下小菌不能够自身合成半胱氨酸和泛酸,以至于体内辅酶A水平很低,可能严重影响其生长。同时流量平衡分析模型iMZ992预测大菌在基础培养基上能够合成并转运到大量代谢物到胞外,包括鸟嘌呤、黄嘌呤、次黄嘌呤、烟酸、泛酸和8种氨基酸。这些物质均己报道对小菌的生长和产酸有不同的促进作用。两菌的GSMMs对分析两菌各自的生理代谢特性提供了一个重要的平台。另外,在此基础上整合两菌GSMMs,构建了基因组规模的两菌系统代谢模型iWZ-Kvu-663-Bme-992。该系统模型可用于分析两菌代谢基因对小菌生长的影响,两菌共培养时代谢流分布,其他组学数据的整合等。

发酵工业 维生素C 生产菌株 系统生物学

邹伟 刘立明 陈坚

江南大学 食品科学与技术国家重点实验室,无锡214122;江南大学 工业生物技术教育部重点实验室,无锡214122

国内会议

第四届全国微生物基因组学学术研讨会

济南

中文

30-30

2012-08-01(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)