荷花玉兰叶绿体全基因组高通量测序及结构解析
荷花玉兰是重要的药用、观赏及园林绿化植物. 本文应用454高通量测序技术对荷花玉兰叶绿体全基因组进行测序,解析了其基因组结构,并与近缘物种基因组进行了比较.荷花玉兰叶绿体基因组全长为159623bp,两个反向互补重复区(IRs)长26563 bp,被分隔的大单拷贝区(LSC)和小单拷贝区(SSC)长度分别为87757bp、18740bp.成功注释129个叶绿体基因,其中18个基因含有内含子.基因种类、数目以及GC含量等与其它木兰科物种相类似.生物信息学分析获得218个SSR1位点,大多位点富含A-T,具有碱基偏好性.木兰科物种的重复基序类型和丰度相对保守,有利于开发叶绿体基因组载体.木兰科基因组的大小及IR区边界的变化与ycfl的长度密切相关,采用30个物种的66个共有蛋白编码基因构建系统发育树,首次在基因组水平上明确了木兰属在被子植物中的进化位置.荷花玉兰叶绿体全基因组序列的获得和结构解析对优良品种培育、叶绿体基因组工程、木兰科物种分子标记开发及系统发育关系的研究具有重要价值.
荷花玉兰 叶绿体全基因组 叶绿体基因工程 木兰科
李西文 高欢欢 宋经元 吴和珍 胡志刚 姚辉 罗红梅
中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所,北京,100193;澳门大学中华医药研究院,澳门,999078 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所,北京,100193;湖北中医药大学药学院,武汉,430065 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所,北京,100193 湖北中医药大学药学院,武汉,430065
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2012-11-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）