灵芝GLUGT1基因的全长cDNA克隆和生物信息学分析
本研究通过对灵芝的基因组测序结果进行分析,采用RT-PCR方法,对其中一条可能参与灵芝三萜合成的UDP-糖基转移酶基因转录本(GL25279)进行全长克隆,并对该基因编码蛋白的理化性质、蛋白二级结构及三维结构等进行了预测与分析.通过全长克隆,得到一条开放阅读框为l491 bp的eDNA序列,命名为GLUGT1.序列分析表明,该基因编码496个氨基酸,蛋白分子量为54.5544 kD,等电点为6.24,属于稳定蛋白.二级结构中α-螺旋占36.69%、β-折叠占11.49%、无规卷曲占51.81%.该蛋白不具有信号肽和跨膜区,最有可能定位在线粒体或者细胞质中.序列比对表明,该蛋白和云芝中的UDP-糖基转移酶EIW63452的相似度较高,为50%.本研究成功克隆并分析了灵芝UGT1的全长序列,为进一步研究灵芝三萜代谢途径奠定基础.
灵芝 UDP-糖基转移酶 三萜合成
郭溆1 罗红梅 陈士林
中国医学科学院 北京协和医学院药用植物研究所/濒危药材繁育国家工程实验室,北京 100193 中国医学科学院 北京协和医学院药用植物研究所/濒危药材繁育国家工程实验室,北京 100193;中国中医科学院中药研究所,北京 100700
国内会议
海口
中文
412-412
2012-11-01(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)