灵芝基因组的转录因子研究
次生代谢产物与转录调控紧密相关.通过结构域预测和序列同源比对,我们在灵芝基因组内鉴定出600多个调控蛋白,约占灵芝预测蛋白的4％.其中249个调控蛋白,与裂褶菌、黄孢原毛平革菌具有共线性,暗示灵芝部分基因调控网络可能是保守的.锌指结构蛋白家族是灵芝基因组内最多的转录因子,与真菌中特殊的次生代谢途径的调控有关,在被鉴定的调控因子中,包含117个具有CCHC结构的蛋白、81个具有C2H2结构的蛋白、73个具有Zn2Cys6结构的蛋白.用antiSMASH或SMURF软件预测到6个锌指蛋白定位在基因簇中.表观遗传修饰在次生代谢调控上同样重要,共33个GCN5相关蛋白,15个PHD相关蛋白,19个SET相关蛋白和8个HDAC相关蛋白.Velvet蛋白是一类在真菌中高度保守的调控蛋白,是子囊菌中响应光信号,调控真菌次生代谢产物合成与生长发育的关键因子.在曲霉属中,Velvet蛋白复合体(VelB-VeA-LaeA三聚体)从表观遗传学层面对基因组进行全局调控,控制子实体发育及柄曲霉素(sterigmatocystin,ST)和盘尼西林(penicillin)合成.通过基因组鉴定,在多种担子菌中也发现了Velvet家族的同源基因,但目前尚未有相应的功能研究报导.
转录因子 次生代谢 锌指蛋白 Velet蛋白 灵芝
汪波 季爱加 徐志超 徐江 胡鸢雷 孙伟 宋经元 孙超 陈士林
中国医学科学院,北京协和医学院药用植物研究所,北京 100193 北京大学,生命科学学院,北京 100871
国内会议
海口
中文
418-419
2012-11-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）