菘蓝转录组注释及活性物质的探索
板蓝根为十字花科菘蓝属植物菘蓝(Isatis Indigotica Fort.)的根，是我国传统中药中重要的清热，解毒，抗炎药材.其药效机制复杂，并未有明确的指标性化合物，同时活性物质的组成也未有详尽的研究.本研究利用454及Solexa两种深度测序拼接的方法，完成了菘蓝的转录组测序及注释，利用解析活性物质合成途径来指示菘蓝中活性物质的存在；同时通过表达谱测序，指示菘蓝中活性物质的生物合成调控，为开展菘蓝中活性物质的代谢调控提供依据.通过转录组测序拼接，共获得了24642条基因的EST序列；并注释了菘蓝中黄酮类、木脂素、吲哚生物碱及甾类化合物等的合成途径，利用共表达分析的方法推测了菘蓝中可能存在的类黄酮及落叶松脂素衍生物；注释了菘蓝中48个转录调控因子家族共924条转录调控因子编码基因，并通过表达谱测序指示了转录调控因子与活性物质合成途径的调控关系.
陈万生
上海长征医院
国内会议
海口
中文
427-427
2012-11-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）