hsa-miR-17-92cluster及其同源体的生物信息学分析
目的：对hsa-miR-17-92 cluster及其同源体进行系统的生物信息学分析,预测其可能参与的生物学过程,为深入研究其在脂肪细胞分化、肥胖发生等过程中的功能与机制奠定基础。方法：①应用Pubmed、Google等信息搜索工具查找hsa-miR-17-92 cluster及其同源体的所有研究,综述已有研究进展；②应用miRBase获取hsa-miR-17-92 cluster及其同源体的各成员序列,并分析其序列特征及保守性；③应用NCBI blast、NCBI mapviewer、UCSC Browser工具分析hsa-miR-17-92cluster及其同源体的所在基因组序列特征；④应用TargetScan,PicTar及miRanda预测hsa-miR-17-92 cluster及其同源体的靶基因,取三者预测结果的交集,进一步进行功能注释(Gene Ontology)和Pathway富集分析(Pathway Enrichment)。结果：①现有研究提示hsa-miR-17-92cluster及其同源体在脂肪细胞分化、肿瘤、心脏及肺发育、免疫系统和血管形成等生物学过程具有重要作用；②hsa-miR-17-92 cluster及其同源体进化上高度保守,根据种子序列同源性可分为四类,且在多物种间非常保守；③hsa-miR-17-92 cluster及其同源体的预测靶基因的功能,与细胞周期、细胞粘附、Wnt、TGF-β信号、P53、MAPK等信号通路具有较大的相关性,可能参与了前列腺癌、胰腺癌、结肠癌等多种疾病通路。结论：通过对hsa-miR-17-92 cluster及其同源体系统的生物信息学分析,我们初步阐明了miR-17-92 cluster及其同源体的基本生物学特征,并为miR-17-92 cluster后续研究提供了功能与机制的线索。
信使核糖核酸 生物信息 基因序列
史春梅 徐广峰 陈玲 赵亚萍 倪毓辉 杨蕾 季晨博 郭锡熔
南京医科大学附属南京妇幼保健院儿童保健科,南京210004;南京医科大学儿科研究所 南京,210029 解放军第八十二医院检验科,江苏淮安223001
国内会议
无锡
中文
396-404
2012-11-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）