hsa-miR-335靶基因预测及生物信息学分析
目的：对hsa-miR-335进行系统的生物信息学分析,预测hsa-miR-335可能参与的生物学过程,为本研究小组深入研究其在脂肪细胞分化中的功能和机制奠定基础.方法：通过miRbase获取并分析hsa-miR-335序列特征；应用TargetScan,PicTar及miRanda预测hsa-miR-335的靶基因,并结合已证实的靶标基因,进行功能注释(GeneOntology)和Pathway富集分析(Pathway Enrichment).应用NCBI Mapviewer、UCSC Genome Browser等工具对hsa-miR-335进行启动子相关预测.结果：miR-335在各物种之间具有高度保守性,其靶基因功能富集于胰腺外分泌、脂质激酶活性调控、wnt受体信号的调控、细胞周期等生物学过程(P＞0.01),其靶基因信号通路富集于促性腺激素释放激素信号通路、MAPK信号通路、胰岛素信号通路、细胞周期等信号转导通路(P＜0.05).启动子预测提示hsa-miR-335为基因内miRNA,在基因组上下游10kb以内存在CDG岛,转录起始位置(TSS)、Poly A信号、转录因子结合位置(TFBS).结论：hsa-miR-335预测的靶基因集合富集于多个生物学过程,与肥胖密切相关,并可能存在其独立的转录调控机制.为后续miR-335在肥胖人脂肪细胞中生物学功能研究奠定基础.
信使核糖核酸 基因检测 生物信息 细胞分化
朱璐 史春梅 徐广峰 季晨博 倪毓辉 郭锡熔 崔焱
南京医科大学,210029
国内会议
无锡
中文
405-409
2012-11-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）