基于高通量测序的甜菜内生细菌多样性
目的：揭示甜菜内生细菌多样性及其演替规律和动态变化。方法：采用液氮研磨法分别提取甜菜组织总DNA，采用通用引物L-V3和R-V3扩增内生细菌16S rDNA的V3区，通过华大基因公司进行12个甜菜内生菌样品的16S rDNA的V3区的Illumina高通量测序平台测序，并进行相应的高级信息学分析。结果：1、甜菜内生细菌具有较高的多样性。其中内生细菌优势菌属为Acidobacteria，Sphingobacteria，Gemmatimonadetes，Alphaproteobacteria，Betaproteobacteria，Deltaproteobacteria，Gammaproteobacteria。2、PCA结果表明样品中内生细菌的相对含量主要由2个主成分决定，即PC1和PC2。3、聚类分析表明甜菜同一生育期内生细菌群落结构相似。在纲水平上甜菜内生细菌的一些类群表现出明显的演替规律。
甜菜 内生细菌 微生物多样性 高通量测序
史应武 杨红梅 张涛 孙建 娄恺
新疆农业科学院微生物应用研究所,乌鲁木齐 830091;新疆乌鲁木齐南昌路403号新疆农科院微生物所
国内会议
纪念中国微生物学会成立六十周年大会暨2012年中国微生物学会学术年会
南京
中文
57-58
2012-10-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）