链孢囊菌SC119的全基因组测序及分析

摘要：

　　链孢囊菌以其孢囊结构区别于其它放线菌,该类菌产生许多生物活性物质,如具有抗真菌活性的sinefungin和ECE抑制剂。前人发现链孢囊菌SC119含有一个小的质粒,对其进行了全基因组序列测定,结果显示SC119染色体为环型,GC含量为70.6％,全长10,745,310bp,除染色体外,SC119还有三个自主复制的环型质粒,分别是6824 bp的pSC1、92,244 bp的pSC2和407,771bp的pSC3。全基因组预测编码9704个基因，其中6122个推测具有特定的功能，3582个为假设性蛋白质。基因组含有80个RNA基因，包括62个tRNA基因和18个rRNA基因。基因组有25个预测的次级代谢产物基因簇。

关键词： 链孢囊菌 全基因组 序列分析 次级代谢产物

作者: 陈建 覃重军

作者单位: 中科院上海生命科学研究院植物生理生态所合成生物学重点实验室,上海市枫林路300号 200032

会议类型: 国内会议

会议名称: 纪念中国微生物学会成立六十周年大会暨2012年中国微生物学会学术年会

会议地点: 南京

会议语种:中文

页码: 160-160

在线出版日期: 2012-10-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）