全基因组分析禾谷镰刀菌、尖孢镰刀菌和轮枝镰刀菌中的MAPK级联信号途径基因
本文利用比较生物学方法,从禾谷镰刀菌、尖孢镰刀菌和轮枝镰刀菌基因组数据库中共找出了31个与酿酒酵母菌同源的三类MAPK级联信号途径基因。它们所编码的蛋白质都含有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶结构域,部分还含有SAM结构域。系统进化表明:这三类镰刀菌的MAPK级联信号途径基因分布于10个不同亚群,每个亚群中都含有三类不同的镰刀菌基因。对每个亚群中三类镰刀菌的蛋白质序列和核苷酸序列进行同源性分析,结果显示除亚群Ⅶ同源性低于90%外,其他亚群均高于90%。这说明MAPK级联信号途径基因在这三类镰刀菌中相当保守。依据进化树和同源比对结果对这三类镰刀菌中不同MAPK级联信号网络关系和基因功能进行预测并绘制了信号网络结构图。这些结果将为深入了解禾谷镰刀菌、尖孢镰刀菌和轮枝镰刀菌的MAPK级联信号途径基因功能及其相关信号网络特点奠定基础。
植物病原菌 促分裂原活化蛋白激酶 信号转导 全基因组 同源性分析
ZHENG Wen-hui 郑文辉 ZHAO Xu 赵旭 HONG Wei-xiong 洪伟雄 WANG Zong-hua 王宗华 Lu Guo-dong 鲁国东
The Functional Genomics Center,Fujian Agriculture and Forestry University,Fujian Fuzhou 350002 福建农林大学功能基因组研究中心,福州350002
国内会议
昆明
中文
32-42
2009-08-07(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)