Tospovirus属病毒的ssRNA-S链的比对分析

摘要：

　　番茄斑萎病毒Tospovirus属引起多种农作物和花卉的严重病害。本文应用生物信息学软件DNAstar、DNAman对Tospovirus属所有成员的RNA-S中的外壳蛋白(NC)和非结构蛋白(NSs)的编码核酸和氨基酸序列进行了较为系统的分析：同源性树状图、进化树图以及一致性(Identity)的值，同源性的值以及进化树的值。同时应用网络软件NPSA和SMART进行了该蛋白质氨基酸组成和蛋白质拓扑结构的预测，发现ssRNA-S链中的NC的特异性非常高。为将来应用RT-PCR或IC-RT-PCR技术鉴定番茄斑萎病毒种的引物设计及致病机制研究提供依据。

关键词： 番茄斑萎病毒 编码核酸 氨基酸序列 结构分析

作者: LIU Ya-ting 刘雅婷 ZHENG Yuan-xian 李正跃 LI Zheng-yue 郑元仙 XU Xiao-gang 徐小刚 LI Yong-zhong 李永忠

作者单位: College of Agricultural and Biotechnology,Yunnan Agricultural University,Yunnan 650201,China 云南农业大学农学与生物技术学院,昆明650201 云南农业大学植保学院,昆明650201 College of plant protection,Yunnan Agricultural University,Yunnan 650201,China College of Tobacco Science,Yunnan Agricultural University,Yunnan 650201,China 云南农业大学烟草学院,昆明650201

会议类型: 国内会议

会议名称: 中国植物病理学会2009年学术年会

会议地点: 昆明

会议语种:中文

页码: 337-344

在线出版日期: 2009-08-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）