草原红牛背最长肌功能基因表达谱的构建
本研究的目的是用基因芯片表达技术构建草原红牛背最长肌功能基因表达谱.采用的方法是用Affynetrix基因芯片对草原红牛背最长肌组织中基因表达情况进行检测,提取总RNA,进行荧光标记探针、杂交、洗涤后分析并对芯片进行验证.结果草原红牛背最长肌组织中公牛与阉牛背最长肌组织总共有22810个探针被检测到.另外以公牛为对照组,利用SAM程序对公牛与阉牛背最长肌肉组织的差异基因进行筛选,差异基因筛选标准为q-value(％)控制在5％以内,差异倍数即Fold Change控制在1.5倍以上.结果共有529个探针在公牛和阉牛中差异表达倍数在1.5倍以上：上调基因435个,下调基因94个.对差异表达基因的GO分析,发现294个基因可以在生物过程功能上找到注释,121个基因在细胞组成功能中找到注释,243个基因在分子功能中找到注释,126个基因未有分类.对差异表达的所有基因经KEGG通路分析显示初生公牛与成年公牛背最长肌529个显著性差异表达基因共涉及208个基因通路改变.
草原红牛 最长肌器官 基因表达谱 转录调控
秦立红 赵志辉
吉林大学畜牧兽医学院,长春130062
国内会议
长春
中文
181-185
2009-12-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）