烟草橙蛋白基因的克隆与生物信息学分析
项目组前期的烟叶基因芯片检测结果表明，类胡萝卜素合成途径的橙蛋白(Orangeprotrin，OR)基因在中间香型与清香型烟叶中呈显著差异表达。<br> 为了获得烟草OR(NtOR)基因的全长序列和进一步揭示其在烟叶特色形成中的作用，采用同源克隆法从烟草品种K326中克隆了NtOR的全长cDNA和基因组DNA序列，GenBank登录号为JN379458和JN375578。生物信息学分析表明，NtOR基因组DNA全长5027 bp，cDNA为1188bp，编码317个氨基酸残基。<br> NtOR蛋白具有2个跨膜域、1个信号肽剪切位点、5个糖基化位点和11个磷酸激酶修饰位点，二级结构包含12个α-螺旋和20个β-折叠，亚细胞定位于质膜上。系统进化与BLAST分析表明NTOR是S1OR和ViOR的垂直同源基因。GENEVESTIGATOR数据库的芯片结果显示，NtOR基因在子叶中的表达量最高，其次是成熟叶片，幼茎和花，其他组织器官的表达相对较弱。
烟草 橙蛋白基因 基因克隆 生物信息学 烟草成分
雷波 卢坤 丁福章 刘小容 胡重怡 潘文杰
西南大学农学与生物科技学院，重庆市北碚区天生路2号 400715 贵州省烟草科学研究所，贵阳市金阳区云潭北路 550081
国内会议
南京
中文
598-598
2012-09-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）