浙南忍冬属药材rbcL基因序列分析
目的:分析浙南忍冬属药用植物叶绿体rbcL基因序列,探讨其差异。方法:Primer Premier 5.0设计引物,用于rbcL基因PCR扩增,ClustalX1.83进行序列全比对。MEGA4.0分析转换值、颠换值等;以七子花Heptacodium miconioides为外类群,邻接法(Neighbor-Joining,NJ)和最大简约法(Maximun Parsimony,MP)进行聚类分析(models:p-distance);自展法(Bootstrap)检验各分支可信度。结果:5种忍冬属药材rbcL基因片段长度在1143bp~1167bp之间,手工校正后长度1137bp,保守位点1126个,变异位点11个,简约信息位点6个,碱基转换和颠换分别为3和2,比值1.6;M P和NJ两种方法所得结果几乎一致,均将5种忍冬属药材分为两大支,黄褐毛忍冬与忍冬为第一大支,红腺忍冬、华南忍冬和灰毡毛忍冬为第二大支。结论:rbcL基因从分子水平分析了5种忍冬属药材的差异,为忍冬属药材鉴定以及系统发育提供了重要参考依据。
中药学 忍冬属 序列分析 聚类分析
李小侠 陶正明 吴志刚 林新春 范传颍
温州医学院,浙江 温州 325035 温州医学院,浙江 温州 325035 浙江省亚热带作物研究所,浙江 温州 浙江省亚热带作物研究所,浙江 温州 亚热带森林培育国家重点实验室培育基地,浙江 临安 325005
国内会议
兰州
中文
294-299
2012-08-14(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)