会议专题

华南地区PEDV S基因抗原表位片段的克隆测序及遗传变异分析

  应用RT-PCR方法对2012年华南地区某大型猪场疑似猪流行性腹泻(PEDV)病料检测,并以病料的Vero细胞第一代培养液的RNA抽提物为模板,进行PEDV S基因抗原位点(1495—1914bp)扩增、克隆后进行了测序。序列对比结果表明:CH/GDGZ/2012与CV777、Chi nju99、Brl/87、DRl 3和SM98的核苷酸序列同源性分别为96.9%、93.0%、95.7%、96?7%和96.0%,氨基酸序列的同源性分别为97.7%、91.5%、95.4%、98.0%和94.8%。进化树分析结果显示:华南地区CH/GD-01/2011、CH/GDGZ/2012、GDHSY/2011、CH/GXQZ/2011毒株与上述几株经典毒株的遗传距离很大,处于不同的亚群。在主要抗原表位(1495~1914bp)氨基酸发生如下变化:502aa L→,S,516aaS→A,548aa T→S,593aa G→S,632aa Q→E。上述结果说明病毒的遗传变异和关键抗原表位发生较大变化,可能是导致2011年来华南地区PEDV的爆发流行主要因素。该研究为诊断和防控该病提供了新的素材。

猪流行性腹泻 冠状病毒 基因序列 遗传变异 华南地区

陈瑞爱 田野 张显浩 贺东生

华南农业大学兽医学院广东省人畜共患病重点实验室,广东广州 510642 广东大华农单位保健品股份有限公司,广东新兴 527400 华南农业大学兽医学院广东省人畜共患病重点实验室,广东广州 510642 广东大华农单位保健品股份有限公司,广东新兴 527400

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2012-09-01(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)