31株野生铁皮石斛的rDNA ITS序列分析
目的：测定和分析31株不同产地来源的野生铁皮石斛样品的rDNA ITS序列，探讨利用ITS序列推测铁皮石斛样品产地来源的可行性。方法：提取总基因组DNA，使用通用引物ITS5F／ITS4R进行PCR扩增，产物经电泳检测、纯化和测序后用Sequin 11．0提交Genbank。用Bioedit 7．0中的Clastal W对Genbank中包括本研究提交的11条在内的所有33条铁皮石斛的ITS序列进行多重序列比对，随后以金钗石斛和密花石豆兰为外群，用邻接法构建NJ系统发育树。结果：从所有测定的ITS序列中选择11条提交Genbank，获得登录号JF803235-JF803245。参考所有已知的铁皮石斛的ITS序列及相关文献报道，对所有铁皮石斛ITS序列的起止位置进行精确定位和编号，共发现645个同源位点，9个信息位点(ITS1区3个，5．8 S区4个，ITS2区2个)。系统发育分析发现，金钗石斛和密花石豆兰位于树的基部，另外32条铁皮石斛共同形成单个大的分支，未发现产地来源与系统树的拓扑结构之间存在对应关系。结论：由于缺乏完善的铁皮石斛标准品及其DNA参考序列的提交标准，同时单个ITS序列仅能提供有限的系统发育信息位点，因此通过ITS序列分析的方法推测铁皮石斛样品的产地来源目前尚不具有可行性。
植物药 铁皮石斛 序列分析 基因测序 产地鉴定
刘鹏 黄松 张桂芳 陈念 赖小平
广州中医药大学中药学院，广东 广州 510006
国内会议
世界中联中药专业委员会第四届学术年会暨中药新药研发与中药资源可持续利用国际研讨会
北京
中文
172-176
2011-12-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）