亚洲棉MicroRNA的鉴定及特性研究
(0) 在本研究中，使用了基于同源搜索的最先进的比较基因组学方法，在亚洲棉栽培种内鉴定出了73个miRNAs，包含在miRNA49个家族中。采用实时定量聚合酶链反应（qRT-PCR），验证了几个预期的miRNAs。这些miRNA的长度为18-22个核苷酸大小，平均长度为20个核苷酸。miRNA前体的长度在46-684个核苷酸范围内，平均长度为1386120个核苷酸。对于大多数亚洲棉miRNAs，每一个家族只有一个miRNA。尽管如此，我们已经鉴定出了大量miRNAs，分别属于miRNA156,414,837,838,1044,1533,2902,2868,5021和5142家族。在亚洲棉miRNA前体中，核苷酸A和U占比例最大，达到62. 95％。亚洲棉miRNA前体具有较高的负相关最小折叠自由能(MFE)、校正最小折叠自由能(AMFE)和较高的最小折叠自由能系数(MFEI)。在亚洲棉中鉴定出了大量的miRNAs，表明在二倍体棉花生长发育过程中，同陆地棉一样，miRNA也起了同样的调控作用。
亚洲棉 比较基因组学 聚合酶链反应 核苷酸 基因鉴定
王清连 董娜 刘阳阳 李成奇
河南科技学院棉花研究所, 新乡453003
国内会议
山西运城
中文
76-76
2012-08-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）