31例综合征性先天性心脏病全基因组拷贝数变异分析
目的:针对综合征性先天性心脏病进行全基因组拷贝数变异(copy number variants, CNVs)的检测及分析,获得其CNVs的检出率,并分析其中罕见CNVs与综合征性先天性心脏病的相关性。方法:纳入标准为存在先天性心脏结构异常,并且合并有一个和/或一个以上其他系统畸形的病例,筛查全基因组拷贝数变异,进行处理,变异数据从3个方面进行分析:①比对己知的综合征性先天性心脏病关键区段及基因;②比对CHD表型一基因型数据库(CHDWiki);③余为尚不明确功能的CNVs,比对己经发表的文献。结果:共纳入病例31例,纳入病例提取外周血全基因组DNA,进行芯片检测。比对DGV数据库除外正常人拷贝数变异202个,发现率为64.5%。①比对已知的综合征性先天性心脏病关键区段及基因,发现重合CNVs共39个,②比对先天性心脏病表型一基因型数据库(CHDWiki),发现重合CNVs共15个。结论:对于综合征性先天性心脏病,采用全基因组拷贝数变异检测分析,可以大大提高对于此类疾病的诊断率。对于罕见CNVs进行全面的分析,可寻找潜在致病性的CNVs,并建立更为精确的表型、基因型的关联性。
先天性心脏病 全基因组检测 基因变异 诊断率
杨琳 詹国栋 王慧君 马端 周文浩 黄国英
复旦大学附属儿科医院,201102
国内会议
广州
中文
133-134
2012-06-01(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)