辣椒环斑病毒的基因组测序与分析
辣椒环斑病毒(chiRSV)是马铃薯Y病毒属的一个新成员,最近它于中国海南以较高的检出率被检测到。除poly(A)尾,本实验测序得到海南分离物ChiRSV-HN/14的基因组序列(GeneBank登陆号为JN008909)长度为9571个核苷酸(nt),其中包含一大一小两个开放阅读框(ORF)。大的0RF包含9240个核苷酸,编码一个由3079个氨基酸聚合而成的多聚蛋白,其分子质量为349.1 kDa:小的ORF即PIPO,在基因组上的位置是2913—3095 nt,编码一个包含60个氨基酸的肽段。chiRSV与同属内其它病毒在核酸和氨基酸水平上的最同源性分别为48.5-65.4%和42.9-68.7%,系统进化树分析进一步表明ChiRSV是马铃薯Y病毒属内一个独立的种。ChiRSV-HN/14与烟草脉带花叶病毒(TVbMV)以及同属内其它两种侵染辣椒的病毒的亲缘关系最近。
辣椒环斑病毒 基因检测 同源性分析
龚殿 王健华 章绍延 张雨良 余乃通 熊忠国 刘志昕
中国热带农业科学院热带生物技术研究所,海南海口 571101 海南大学环境与植物保护学院,海南海口 570228 中国热带农业科学院热带生物技术研究所,海南海口 571101 亚利桑那大学植物科学系,美国图森 Az85721
国内会议
2011年度中国热带作物学会遗传育种专业委员会年会暨学术研讨会
南昌
中文
16-19
2011-08-01(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)