红斑丹毒丝菌spaA抗原基因的克隆、序列分析及蛋白结构预测
参照红斑丹毒丝菌表面抗原A(spaA)基因的核苷酸序列合成一对引物,对我国生产用红斑丹毒丝菌CVCC43005的SpaA全基因进行了PCR扩增,扩增产物连接到pMD18-T载体上,进行序列测定和分析.结果表明,SpaA基因全长1881 bp,含有1个开放性阅读框,编码626个氨基酸。与已提交的红斑丹毒丝菌血清型1a、1b,2a、2b、5、8、9、12、15、16、17、和N型的氨基酸同源性为97.5%-100%,血清型4、6、11、19、21的氨基酸同源性为52.8%-55.2%。与已提交的丹毒丝菌血清型18的氨基酸同源性为57.5%-58.0%。采用Chou-Fasman和Karplus-Schulz方案预测蛋白质的二级结构和柔性区域;运用Kyte-Doolittle方案预测氨基酸的亲水性,按Jameson-Wolf方案预测抗原指数,利用Emini方案预测蛋白质的表面可及性.对预测结果综合分析,推测最有可能的B细胞表位位于N端的59-64,85-91,174-186,193-201,212-215,221-231,266-275,278-288,291-308,314-327,329-349,356-376,403-456,508-516,528-537,568-576和607~626。
红斑丹毒丝菌 抗原基因 基因克隆 序列分析 蛋白质结构
李伟杰 赵耘 康凯 岂晓鑫 杜昕波 陈敏
中国兽医药品监察所,北京 100081
国内会议
兰州
中文
200-207
2011-09-01(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)