新型三维氨基酸结构描述符的研究及其在多肽QSAR中的应用
目的:建立一套新型的氨基酸结构描述符,用此描述符进行多肽的定量构效关系研究。方法:通过理论计算得出167个氨基酸结构描述参数,再对167个参数进行主成份分析,从中提取出与氨基酸的三维结构性质密切相关的三个结构描述参数c1、c2、c3-scales。采用G/PLS算法,建立氨基酸结构描述符c-scales与多肽生物活性之间的函数关系,确定多肽的QSAR模型。结果:用此方法建立的缓激肽增效剂和ω一芋螺毒素的QSAR模型的相关系数和交叉验证相关系数,均在0.80以上。结论:氨基酸结构描述符c-seales,定量的描述了氨基酸的空间结构性质,利用此方法能建立预测能力很强的多肽QSAR模型。
氨基酸结构描述符 多肽药物 定量构效关系 主成份分析法 遗传偏最小二乘算法
丁俊杰 丁晓琴 赵立峰c 陈冀胜
北京药物化学研究所 北京 1044信箱 401 号,北京 102205
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5-10
2003-12-12(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)