十字花科植物HSP22基因同源序列的克隆与进化分析
采用PCR克隆技术,根据已报道的拟南芥的AtHSP22.0基因全长及其它物种同源序列设计特异引物,在十字花科植物大白菜、青菜、甘蓝型油菜CY、花椰菜、荠菜、芥菜、萝卜、芥菜型油菜川黄中克隆得到耐热相关基因AtHSP22.0的同源序列。测序得到的各物种的HSP22基因核苷酸序列,同GenBank中搜索获得拟南芥序列和亲缘关系较远的单子叶植物玉米的HSP22基因序列进行多序列联配。对得到的比对结果用MEGA4.0软件构建NJ系统树。相应氨基酸结构域及特性用ExPasy在线分析。二级结构用Bioinformatics & Biological computing在线分析。三维模型通过SWISS-MODEL完成。用MOLMOL对蛋白质的三级结构中多肽段定位,并绘制三级结构图。
十字花科植物 PCR克隆技术 HSP22基因 序列分析
程影 黄锐芝 钟新民 吴学龙 王五宏 刘智宏 李必元
南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室,南京 210095 浙江省农业科学院蔬菜研究所,杭州 310021 浙江省农业科学院病毒学与生物技术研究所,浙江省植物代谢基因工程试验基地,杭州 310021 浙江省农业科学院蔬菜研究所,杭州 310021
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2011-10-19(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)