2009~2010年北京儿童腹泻中轮状病毒新VP4基因亚型的研究
目的：P”8”b基因亚型是国内外新近发现的A组人轮状病毒(HRV)VP4基因的一种新亚型。建立有效鉴别HRV P”8”a, P”8”b,P”4”及P”6”基因(亚)型的VP4基因打点杂交分型方法。方法：通过对GenBank序列数据库可检索到的国内外HRV各种P基因型及P”8”b亚型的VP4基因序列应用DNAStar和Meglign软件进行VP4基因分析，在不同基因型别间核昔酸变异密集而相同P基因型内核昔酸高度保守的的位置设计各型别探针，并分别以本实验室上传GenBank的北京HRV地方株常见基因(亚)型P”8”a, P”4”, P”6”及新近发现的P”8”b亚型的VP4基因作为相应型别探针的合成引物的设计模板及探针经PCR合成的合成模板，合成地高辛素标记的DNA探针。结果：经测序验证所建立的VP4基因杂交分型方法结果特异、无交叉杂交及反应背景。对门诊88例(55%, 88/160)及住院79例(70.5%, 79/112) HRV腹泻患儿的P分型结果显示P”8”a亚型仍为主要型别，前者为%.6%(85/88)，而后者为62.0%(49/79)；P”8”b亚型在住院HRV感染腹泻患儿中占较高比例(27.9%, 22/79),且其在门诊HRV感染患儿中也存在，但仅占2.3%, (2/88)；本组标本中HRV P”8”b亚型主要与G9型组合。此外单纯P”4”基因型HRV感染仅在住院腹泻患儿中检测到I例((1.3%, 1/79)，而P”6”基因型在门诊及住院HRV感染腹泻患儿中均未检测到。结论：本研究建立的VP4基因杂交分型方法是特异、可靠的，是对经典巢式PCR分型方法的一个有效的改进和补充。
儿童腹泻 轮状病毒 序列分析 基因杂交分型
董慧瑾 钱渊 张又 邓莉 赵林清 朱汝南 陈冬梅 刘立颖 贾立平
首都儿科研究所病毒研究室 北京 100020
国内会议
西安
中文
52-53
2011-09-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）