人副流感病毒广州分离株ZYMgz01全基因组序列测定及分析
目的：探讨广州地区副流感病毒的基因组结构和基因型。方法：参照GeneBank副流感病毒(U51116)全基因组序列设计11对引物,覆盖副流感病毒基因组的全长。以副流感病毒cDNA为模板分段扩增病毒基因组全长克隆到T载体上,序列测定及使用Clustal W、DNAMAN等软件分析。结果：人副流感病毒ZYMgz01株全基因组核酸序列为15462bp,提交到GenBank的序列号为EU326526,与3型副流感病毒保守基因同源性为94.0%,具有3型副流感病毒的结构特征。基因组序列同源性比较结果显示,ZHYMgz01株病毒与兰州的LZ22(FJ455842)病毒株的同源性最高,为99.1%；与美国突变病毒株(U51116)同源性为95.1%；与美国病毒株(Z11575)同源性为95.2%；与日本(ABO12132)病毒株的同源性为94.8%,而与加拿大(EU424062)病毒株的同源性为94.8%。系统进化树显示ZHYMgz01病毒株与兰州的LZ22病毒株同属一个进化分支。结论：广州地区儿童呼吸道感染的副流感病毒ZHYMgz01全基因组为15462bp,与3型副流感病毒的同源性最高,确定ZHYMgz01是3型副流感病毒。3型副流感病毒系统进化可能与地域差异有一定的关系。
人副流感病毒 基因组结构 序列分析 同源性
陈翊 周荣 钟家禹 朱冰
广州市妇女儿童医疗中心病毒研究室,广州 510120
国内会议
西安
中文
61-67
2011-09-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）