苎麻镉胁迫响应基因表达研究
重金属污染是全球性生态安全问题，有关Cd污染土壤的治理和植物修复等问题已成为科研热点。从长远看，植物修复技术的发展方向将依赖于富集分子机理的阐明和转基因富集型植物的研发，鉴定和克隆出自然界中一批能抵抗或富集重金属的基因，并通过转基因技术，获得重金属高效修复或重金属排斥的新型工程植物。本研究利用solexa高通量测序技术对Cd处理和对照(未加Cd处理)的苎麻根系全基因组进行测序，构建了对照(未加Cd处理)和100mg/kgCd处理的苎麻根系数字表达基因数据库。分别获得了3,654,395和3,572,333个tag，Clean tag分别占测序总数的93.18％和93.76%。通过数据分析，在对照和处理间共筛选到差异表达基因3887个，包含2883个上调基因和1004个下调基因，blast比对发现其中大部分差异表达基因为未知基因，有待进一步发掘利用。对功能已知差异表达基因进行功能注释富集分析这些基因的主要功能为结合和催化活性，包括依赖金属的水解酶类，锌指蛋白，DNA结合蛋白，翻译起始因子和翻译延伸因子、氧化还原酶、蛋白磷酸酶等；通过GO分析发现差异表达基因主要富集在质膜和液泡，说明参与耐镉的分子主要在这两个部位上起作用；苎麻差异表达基因主要富集途径为谷胱甘肽代谢途径以及半胱氨酸、甲硫氨酸代谢途径。这两个途径能提高植物对过氧化物的清除能力从而提高植物本身抗氧化胁迫能力。
苎麻 重金属污染 镉胁迫响应基因 植物修复技术
揭雨成 佘玮 邢虎成 朱守晶 周精华 蒋杰 王亮
湖南农业大学苎麻研究所,湖南省作物种质创新与资源利用重点实验室,湖南长沙 410128
国内会议
沈阳
中文
47
2010-09-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）